在使用显微镜观察深色样品时，若发现图像不清楚，可以从以下几个方面尝试解决问题：

1. **照明调整**：

   - **亮度控制**：由于深色样品通常会吸收更多的光线，因此可能需要增加光源强度或者调整聚光器的高度，确保足够的光线能够通过样品并反射或透射回来。

   - **暗场或明场模式**：根据样品特性选择合适的观察模式，比如暗场照明对于某些细节可能更有利，因为它可以突出显示样品表面的细微起伏。

2. **对比度增强**：

   - **相位对比**：对于生物样品，如果显微镜具备相位对比功能，可以启用它以增强细胞结构之间的对比度。

   - **DIC（微分干涉对比）**：类似地，微分干涉对比也是一种增强透明或半透明样品内部结构对比度的技术。

3. **滤光片**：

   - 使用适当的滤光片可以帮助减少散射光，提高图像对比度。

4. **样品制备**：

   - 确保样品适当染色，以便更好地与背景区分。对于非染色样品，可能需要考虑化学固定、脱水以及应用适合深色样品的染料。

5. **焦平面调整**：

   - 调整粗调和微调焦螺旋，找到最佳的焦平面，确保聚焦清晰。

6. **相机曝光时间和增益**：

   - 如果是通过摄像头采集图像，可能需要调整曝光时间和增益参数，避免过度曝光或欠曝。

7. **检查光学部件**：

   - 清洁物镜和目镜，确保它们没有污渍或雾气影响图像质量。

8. **更换或调整物镜**：

   - 根据样品特点选择合适放大倍数和数值孔径（NA）的物镜，高数值孔径物镜能提供更好的分辨率和对比度。

综合以上措施，可以根据实际情况针对性地改善显微镜观察深色样品时图像不清楚的问题。